Dans la Bibliothèque, les rouleaux ainsi rassemblés étaient étiquetés et rangés dans des casiers, à l'intérieur d'armoires murales, d’abord classés par disciplines (textes littéraires, philosophiques, scientifiques et techniques) puis par auteur. On y trouvait tout Homère (20 versions de l'Odyssée), Sophocle, Euripide, Anaximandre, « La sphère et le mouvement » Autolycos de Pitane, Les « Éléments » d'Hippocrate de Chios, la bibliothèque entière d'Aristote....... A l’époque de Callimaque, on recensait ainsi plus de 400 000 rouleaux de compilation (contenant chacun probablement plus qu’un simple paragraphe ou propos d’un auteur)… 90 000 rouleaux « bruts » … plus un additif de 42 000 documents conservés au Sérapéum. Autre nouveauté et non des moindres : Le poste de bibliothécaire fut créé. A l'origine, cet homme ne devait pas être plus qu'un simple précepteur. Mais la bibliothèque s’enrichissait tellement vite, et avec elle l'importance de la connaissance de son organisation, que le bibliothécaire dut apprendre à connaître son lieu de travail. Il devint ainsi « un recueil de références » humain… qui fut vite dépassé. On conçut alors « le Catalogue » pour l’aider dans son travail d’organisation. Le premier véritable poste de bibliothécaire apparut dès la fin du règne de Ptolémée I en 245 avant J.C. Il fut tenu par Zenodotus d’Ephèse. Son successeur, Callimaque du Cyrène (poète renommé et Maître d’Eratosthène) fut certainement le plus célèbre d’entre eux. On lui doit le premier vrai catalogue comportant 120 000 références de documents de la Bibliothèque. Son jeune rival, Apollonius de Rhodes, un écrivain rendu célèbre par son récit épique « Argonautica », semble l’avoir remplacé quelques temps. Puis ce fut le tour d’Eratosthène de Cyrène, un stoïcien géographe et mathématicien qui assura la charge dès 235 avant J.C. On lui doit un « organigramme » des contenus de la Bibliothèque. En 195 avant J.C., le poste fut reprit par Aristophane, personnage n’ayant aucun rapport avec l’auteur grec célèbre pour ses comédies. Cet Aristophane était réputé pour son excellente mémoire : Il la cultivait en lisant tous les jours des livres de la Bibliothèque dans l'ordre de leur disposition. Enfin selon certaines sources, Aristarque de Samos, le grand astronome qui calcula les distances Terre-Lune et Terre-Soleil, aurait aussi assuré les fonctions de bibliothécaire.
Par la suite, la Bibliothèque persista encore de nombreux siècles, mais aucun nom de bibliothécaire ne fut jamais plus mentionné. Le développement de la Bibliothèque et les moyens mis en œuvre pour augmenter son contenu furent à la mesure du défi de Ptolémée et de ses descendants. Ce fut surtout sous le règne de Ptolémée II Philadelphe que la Bibliothèque s'enrichit de nombreux volumes. Un recensement des ouvrages fut d'ailleurs accompli : 500 000 rouleaux y étaient conservés, ce qui équivalait à peu près à 30 000 œuvres complètes ! (A son apogée, moins de trois siècles plus tard, on dénombrait 700 000 rouleaux). Ptolémée II fit même construire un second Temple-Bibliothèque, le Sérapéion appelé aussi la "Bibliothèque-Fille", qui était ouvert à tous. En plus de collecter les œuvres écrites, les Ptolémées firent appel aux Savants et aux Philosophes pour travailler et commenter les ressources accumulées. En permanence, on comptait en moyenne 100 lettrés dans les murs du Musée. Le prestige acquis par la Bibliothèque devint si considérable que l'on peut dire que ce fut là que furent faites toutes les grandes découvertes pendant 500 ans. Le projet de la Bibliothèque demandait également la présence des ouvrages en langues barbares pour compléter les collections. Des savants se mirent donc à traduire certains de ces écrits. Parmi ces traductions, on trouva les volumes du Pentateuque, fondements du Judaïsme. L'initiative des Ptolémée montre leur volonté de conquête des cultures étrangères. Mais le fait que des Juifs aient acceptés est tout aussi significatif : Ils souhaitent répandre leur foi par ce système, chacun gagnait donc à cette traduction.
A la fin du premier siècle avant J.C. éclatèrent de graves conflits de succession qui aboutirent à la guerre avec Rome Durant cette période troublée, la Bibliothèque qui avait fait rayonner la culture grecque dans le « monde entier », connut un triste destin. En 48 av. J.C., Jules César qui soutenait Cléopâtre contre son frère Ptolémée XIII fut victime d’une révolte populaire et se trouva assiégé dans Alexandrie. La suite est sujette à caution : Pour bloquer la flotte de Ptolémée (?), César aurait fait incendier tous les navires qui se trouvaient dans le Grand Port et ce feu se serait répandu… Mais certains pensent qu'il aurait brûlé des entrepôts où se trouvaient disposées des copies de volumes destinées à être envoyées dans d'autres pays… D'autres assurent que la Bibliothèque aurait été touchée car elle était trop proche du port (on ne connaît pas en effet sa position exacte). L'incendie aurait dévasté entre 40 000 et 400 000 rouleaux. Mais il faut se rappeler que beaucoup n’étaient que des copies. La plupart des ouvrages précieux ou du moins leurs copies purent être préservés des flammes. Pour César, la tactique fut payante, la flotte romaine put arriver à temps et vaincre la flotte de Ptolémée XIII qui fut tué au cours des combats. (Pour tenter de réparer le préjudice, César fera construire par la suite une nouvelle Bibliothèque, le Césarum.) Désormais veuve, Cléopâtre, se remaria avec son autre frère qui devint Ptolémée XIV. Pas pour très longtemps car elle le fit rapidement assassiner. César retourna à Rome où Cléopâtre le rejoignit bientôt. Là, elle tomba amoureuse d'un autre général, Antoine. Celui-ci pilla la bibliothèque de Pergame, la rivale de celle d’Alexandrie, et fit transporter 200 000 volumes à Alexandrie pour les offrir à Cléopâtre qui désirait reconstituer la Grande Bibliothèque.
Mais, la richesse d'Alexandrie avait suscité la convoitise. Son pouvoir politique inquiétait Rome, dont la puissance s'affirmait.
En 30 avant J.C., Octave-Auguste, futur Empereur, profita des faiblesses dues aux luttes dynastiques pour prendre le contrôle de l'Egypte. Après l'arrivée d'Octave-Auguste dans le port d'Alexandrie, Cléopâtre se suicida. Débuta alors une période de gouvernement romain où, à l'inverse des autres provinces conquises, l'Egypte devint la propriété personnelle de l'Empereur … Et la Grande Bibliothèque sombra lentement dans l’oubli.
(http://coll-ferry-montlucon.planet-allier.com/alexandr.htm)
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